April O’Neil revient d’Ellis Island lorsque, dans un éclair de lumière, son public et elle-même sont témoin du rétrécissement de l’île de Manhattan. Shredder détourne ensuite les ondes TV et annonce au monde que ce fut seulement une démonstration de la puissance de l’Hyperstone, le trésor de la Dimension X. Avec l’Hyperstone en sa possession, il a maintenant le pouvoir de conquérir le monde. Les tortues n’ont pas d’autre choix que de partie à la recherche de Shredder et l’arrêté.